期刊简介
本刊系医药卫生类综合性学术期刊，主要刊登医学基础研究、临床实验研究、预防医学和全科医学方面的论著、综述，也刊登临床方法学、经验介绍方面的论文。
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首页>徐州医科大学学报杂志
- 杂志名称：徐州医科大学学报杂志
- 主管单位：江苏省教育厅
- 主办单位：徐州医科大学
- 国际刊号：2096-3882
- 国内刊号：32-1875/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：1992年徐州市科技期刊一等奖期刊收录：知网收录(中), 维普收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, CA 化学文摘(美)
田鼠巴贝虫GAPDH蛋白特性和抗原表位的生物信息学分析
李会琴；陈泽天；郑辰；闫红茹；付琳琳；郑葵阳；刘相叶
关键词：田鼠巴贝虫, 3-磷酸甘油醛脱氢酶, 生物信息学分析, 蛋白特性, 抗原表位
摘要：目的 分析田鼠巴贝虫3-磷酸甘油醛脱氢酶(BmGAPDH)的蛋白特性和抗原表位.方法 运用ORF Finder、PROSITE、ProtParam、SignalP、TMHMM Server、SOUSI、MotifScan、Bcepred、HNN等生物信息学软件分析预测BmGAPDH基因的开放阅读框和编码蛋白的特征结构域、理化性质、信号肽、跨膜结构域、稳定性、可溶性、翻译后修饰位点、亲水性、柔韧性、表面可及性、二级结构等特性;同时结合DNAStar和SWISS-MODEL软件分别预测蛋白的抗原表位和三维空间结构.结果 BmGAPDH由1074个核苷酸编码的357个氨基酸组成,其特征结构域位于170-177位氨基酸残基.编码蛋白相对分子质量为3.833309×104,分子式为C1700H2723N457O514S17,理论等电点为6.98,不存在信号肽,有1个跨膜区,23个翻译后修饰位点,6个亲水性参数得分≥1.9的区域,3个柔韧性参数得分≥2.0的区域,10个表面可及性参数得分≥1.9的区域,8个潜在的B细胞抗原表位,19个潜在的T细胞抗原表位,在溶液中性质稳定,且为疏水性蛋白.BmGAPDH蛋白和人类的GAPDH蛋白序列覆盖率为56%,相似性为70%.结论 BmGAPDH含有多种抗原表位,且含量丰富,具有成为巴贝虫病疫苗候选抗原的潜在特性.
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